办理昆明工程保函主要有以下步骤：

确定保函类型：根据具体需求，确定是办理投标保函、履约保函、质量保函还是其他类型的工程保函。

选择保函提供机构：可以选择银行、保险公司或其他专业机构来提供保函服务。选择时需要考虑机构的信誉、财务实力、服务能力等因素。

提供申请资料：按照保函提供机构的要求，准备好申请资料。通常包括企业资质证明、申请表格、合同文件、担保准备金等。

缴纳费用：根据机构要求，支付相应的保函费用。费用通常包括手续费、担保费等。支付方式可以是现金、转账等。

审核和评估：保函提供机构会对申请资料进行审核和评估，包括对企业资质、信用状况、项目情况等的综合评估。

签署保函协议：通过审核后，双方签署保函协议，明确保函的金额、期限、条件等。同时，提供申请人的相关担保物或实行资金保全措施。

签发保函：机构在确认申请人符合要求后，会签发保函，并将保函交给申请人。

使用保函：申请人在合同中将保函作为担保凭证提交给对方。在合同履约期间，如出现需要保函的情况，对方可以通过保函来索取相应的赔偿金额。

请注意，以上步骤仅供参考，具体办理流程可能会因不同的要求而有所不同。因此，在办理工程保函前，建议咨询专业机构并详细了解其要求和流程。